R-bundle-CRAN 2025.06-foss-2024a

Bundle of R packages from CRAN

Accessing R-bundle-CRAN 2025.06-foss-2024a

To load the module for R-bundle-CRAN 2025.06-foss-2024a please use this command on the BEAR systems (BlueBEAR and BEAR Cloud VMs):

📋 module load bear-apps/2024a
module load R-bundle-CRAN/2025.06-foss-2024a

BEAR Apps Version

2024a

Architectures

EL8-emeraldrapids — EL8-icelake — EL8-sapphirerapids

The listed architectures consist of two parts: OS-CPU. The OS used is represented by EL and there are several different processor (CPU) types available on BlueBEAR. More information about the processor types on BlueBEAR is available on the BlueBEAR Job Submission page.

Extensions

• abc 2.2.2
• abc.data 1.1
• abe 5.1.2
• abind-1.4-8
• acepack 1.6.1
• adabag 5.0
• ade4-1.7-23
• ADGofTest 0.3
• admisc 0.38
• aggregation 1.0.1
• AICcmodavg-2.3-4
• akima-0.6-3.6
• alabama 2023.1.0
• AlgDesign 1.2.1.2
• alluvial-0.1-2
• AMAPVox 2.2.1
• animation 2.7
• aod 1.3.3
• apcluster 1.4.13
• ape-5.8-1
• aplot 0.2.5
• argparse 2.2.5
• aricode 1.0.3
• arm-1.14-4
• arrayhelpers-1.1-0
• asnipe 1.1.17
• assertive-0.3-6
• assertive.base-0.0-9
• assertive.code-0.0-4
• assertive.data-0.0-3
• assertive.data.uk-0.0-2
• assertive.data.us-0.0-2
• assertive.datetimes-0.0-3
• assertive.files-0.0-2
• assertive.matrices-0.0-2
• assertive.models-0.0-2
• assertive.numbers-0.0-2
• assertive.properties-0.0-5
• assertive.reflection-0.0-5
• assertive.sets-0.0-3
• assertive.strings-0.0-3
• assertive.types-0.0-3
• assertthat 0.2.1
• AUC 0.3.2
• audio-0.1-11
• aws-2.5-6
• awsMethods-1.1-1
• backports 1.5.0
• bacr 1.0.1
• bartMachine 1.3.4.1
• bartMachineJARs 1.2.1
• base64 2.0.2
• BatchJobs 1.9
• batchmeans-1.0-4
• BayesianTools 0.1.8
• BayesLogit 2.1
• bayesm-3.1-6
• BayesPen 1.0
• bayesplot 1.12.0
• bayestestR 0.16.0
• BB-2019.10-1
• BBmisc 1.13
• bbmle 1.0.25.1
• BCEE 1.3.2
• BDgraph 2.73
• bdsmatrix-1.3-7
• beanplot 1.3.1
• beepr 2.0
• beeswarm 0.4.0
• berryFunctions 1.22.5
• betareg-3.2-3
• BH-1.87.0-1
• BiasedUrn 2.0.12
• bibtex 0.5.1
• BIEN 1.2.7
• bigD 0.3.1
• BIGL 1.9.3
• biglm-0.9-3
• bigmemory 4.6.4
• bigmemory.sri 0.1.8
• bindr 0.1.2
• bindrcpp 0.2.3
• bio3d-2.4-5
• biom 0.3.12
• biomod2-4.2-6-2
• bit 4.6.0
• bit64-4.6.0-1
• bitops-1.0-9
• blavaan-0.5-8
• blob 1.2.4
• BMA 3.18.20
• bmp 0.3
• bnlearn 5.0.2
• bold 1.3.0
• boot-1.3-31
• bootstrap 2019.6
• Boruta 8.0.0
• brglm 0.7.2
• bridgedist 0.1.3
• bridgesampling-1.1-2
• brms 2.22.0
• Brobdingnag-1.2-9
• broom 1.0.8
• broom.helpers 1.21.0
• broom.mixed 0.2.9.6
• bst-0.3-24
• Cairo-1.6-2
• calibrate 1.7.7
• car-3.1-3
• carData-3.0-5
• cards 0.6.0
• caret-7.0-1
• catlearn 1.1
• caTools 1.18.3
• CBPS 0.23
• celestial 1.4.6
• cellranger 1.1.0
• cgdsr 1.3.0
• cghFLasso-0.2-1
• changepoint 2.3
• checkmate 2.3.2
• chemometrics 1.4.4
• chk 0.10.0
• chkptstanr 0.1.1
• chron-2.3-62
• circlize 0.4.16
• circular-0.5-1
• class-7.3-23
• classInt-0.4-11
• cld2 1.2.6
• clisymbols 1.2.0
• clock 0.7.3
• clue-0.3-66
• cluster 2.1.8.1
• clusterGeneration 1.3.8
• clusterRepro 0.9
• clustree 0.5.1
• clValid 0.7
• cmna 1.0.5
• cmprsk-2.2-12
• cNORM 3.4.1
• cobalt 4.6.0
• cobs-1.3-9
• coda-0.19-4.1
• codetools-0.2-20
• coin-1.4-3
• collapse 2.1.2
• colorspace-2.1-1
• colourpicker 1.3.0
• cols4all 0.8
• combinat-0.0-8
• ComICS 1.0.4
• ComplexUpset 1.3.3
• compositions-2.0-8
• CompQuadForm 1.4.3
• conditionz 0.1.0
• configr 0.3.5
• conflicted 1.2.0
• conquer 1.3.3
• ConsRank 2.1.5
• contfrac-1.1-12
• copCAR-2.0-4
• copula-1.1-6
• corpcor 1.6.10
• corrplot 0.95
• covr 3.6.4
• CovSel 1.2.2
• covsim 1.1.0
• cowplot 1.1.3
• coxed 0.3.3
• coxme-2.2-22
• cplm-0.7-12.1
• crfsuite 0.4.2
• crosstalk 1.2.1
• crul 1.5.0
• cSEM 0.6.1
• csSAM 1.2.4
• ctmle 0.1.2
• cubature 2.1.4
• cubelyr 1.0.2
• cvAUC 1.1.4
• CVST-0.2-3
• CVXR-1.0-15
• d3Network 0.5.2.1
• dagitty-0.3-4
• data.table 1.17.4
• data.tree 1.1.0
• DataCombine 0.2.21
• datawizard 1.1.0
• date-1.2-42
• dbarts-0.9-32
• DBI 1.2.3
• dbplyr 2.5.0
• dbscan 1.2.2
• dcurver 0.9.2
• ddalpha 1.3.16
• deal-1.2-42
• debugme 1.2.0
• deldir-2.0-4
• dendextend 1.19.0
• DEoptim-2.2-8
• DEoptimR-1.1-3-1
• DepthProc 2.1.5
• Deriv 4.1.6
• DescTools 0.99.60
• deSolve 1.40
• dfidx-0.1-1
• DHARMa 0.4.7
• dHSIC 2.1
• diagram 1.6.5
• DiagrammeR 1.0.11
• DiceKriging 1.6.0
• dichromat-2.0-0.1
• dimRed 0.2.7
• diptest-0.77-1
• DiscriMiner-0.1-29
• dismo-1.3-16
• distillery-1.2-2
• distr 2.9.7
• distrEx 2.9.6
• distributional 0.5.0
• DistributionUtils-0.6-2
• diveRsity 1.9.90
• dlm-1.1-6.1
• DMCfun 4.0.1
• doBy 4.6.27
• doc2vec 0.2.0
• docstring 1.0.0
• doMC 1.3.8
• doParallel 1.0.17
• doRNG 1.8.6.2
• doSNOW 1.0.20
• dotCall64 1.2
• downloader 0.4.1
• dplyr 1.1.4
• dr 3.0.11
• dreamerr 1.5.0
• drgee-1.1.10-3
• DRR 0.0.4
• drugCombo 1.2.1
• DT 0.33
• dtangle 2.0.9
• dtplyr 1.3.1
• DTRreg 2.3
• dtw-1.23-1
• dummies 1.5.6
• dygraphs 1.1.1.6
• dynamicTreeCut-1.63-1
• e1071-1.7-16
• earth 5.3.4
• EasyABC 1.5.2
• ECOSolveR 0.5.5
• ellipse 0.5.0
• elliptic-1.4-0
• emdbook 1.3.13
• emmeans 1.11.1
• emoa-0.5-3
• emulator-1.2-24
• energy-1.7-12
• ENMeval 2.0.5.2
• entropy 1.3.2
• EnvStats 3.1.0
• epitools-0.5-10.1
• ergm 4.8.1
• ergm.count 4.1.2
• ergm.multi 0.2.1.1
• estimability 1.5.1
• EValue 4.1.3
• evd-2.3-7.1
• Exact 3.3
• expm-1.0-0
• ExPosition 2.11.0
• expsmooth 2.3
• extrafont 0.19
• extrafontdb 1.0
• extRemes-2.2-1
• FactoMineR 2.11
• FactorCopula 0.9.3
• fail 1.3
• farver 2.1.2
• fastcluster 1.3.0
• fastDummies 1.7.5
• fasterize 1.1.0
• fastGHQuad 1.0.1
• fastICA-1.2-7
• fastlogranktest 0.2.1
• fastmatch-1.1-6
• fBasics 4041.97
• fdrtool 1.2.18
• feather 0.3.5
• ff 4.5.2
• fftw-1.0-9
• fftwtools-0.9-11
• fields 16.3.1
• filehash-2.4-6
• finalfit 1.0.8
• findpython 1.0.9
• fishMod 0.29.2
• fitdistrplus-1.2-2
• fixest 0.12.1
• FKSUM 1.0.1
• flashClust-1.01-2
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• flexmix-2.3-20
• flextable 0.9.9
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• FME 1.3.6.3
• fmri 1.9.12.1
• FNN 1.1.4.1
• fontBitstreamVera 0.1.1
• fontLiberation 0.1.0
• fontquiver 0.2.1
• forcats 1.0.0
• foreach 1.5.2
• forecast 8.24.0
• foreign-0.8-90
• formatR 1.14
• Formula-1.2-5
• formula.tools 1.7.1
• fossil 0.4.0
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• fpp 0.5
• fracdiff-1.5-3
• frbs-3.2-0
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• futile.logger 1.4.3
• futile.options 1.0.1
• future 1.49.0
• future.apply 1.11.3
• gam-1.22-5
• gamlss-5.4-22
• gamlss.data-6.0-6
• gamlss.dist-6.1-1
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• gamm4-0.2-7
• gap 1.6
• gap.datasets 0.0.6
• gapfill-0.9.6-1
• gargle 1.5.2
• gaussquad-1.0-3
• gbm 2.2.2
• gbRd 0.4.12
• gclus 1.3.3
• gcmr 1.0.4
• gdata 3.0.1
• gdistance 1.6.4
• gdtools 0.4.2
• gee-4.13-29
• geeM 0.10.1
• geepack 1.3.12
• geex 1.1.1
• geiger 2.0.11
• GeneNet 1.2.17
• generics 0.1.4
• genoPlotR 0.8.11
• GenSA 1.1.14.1
• geojsonsf 2.0.3
• geometries 0.2.4
• geometry 0.5.2
• getopt 1.20.4
• GetoptLong 1.0.5
• gfonts 0.2.0
• GGally 2.2.1
• ggbeeswarm 0.7.2
• ggdag 0.2.13
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• GPArotation-2025.3-1
• gplots 3.2.0
• graphlayouts 1.2.2
• grf 2.4.0
• gridBase-0.4-7
• gridExtra 2.3
• gridGraphics-0.5-1
• grImport2-0.3-3
• grpreg 3.5.0
• GSA 1.03.3
• gsalib 2.2.1
• gsDesign 3.6.8
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• gsw-1.2-0
• gt 1.0.0
• gtable 0.3.6
• gtools 3.9.5
• gtsummary 2.2.0
• GUTS 1.2.5
• gWidgets2-1.0-10
• gWidgets2tcltk-1.0-9
• GxEScanR 2.0.2
• h2o 3.44.0.3
• hal9001 0.4.6
• haldensify 0.2.3
• hardhat 1.4.1
• harmony 1.2.3
• hash 2.2.6.3
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• hdf5r 1.3.12
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• here 1.0.1
• hexbin 1.28.5
• HGNChelper 0.8.15
• HiddenMarkov-1.8-14
• Hmisc-5.2-3
• hms 1.1.3
• Hmsc-3.0-13
• htmlTable 2.4.3
• httpcode 0.3.0
• huge 1.3.5
• hunspell 3.0.6
• hwriter 1.3.2.1
• hypergeo-1.2-14
• ica-1.0-3
• IDPmisc 1.1.21
• idr 1.3
• ids 1.0.1
• ie2misc 0.9.1
• igraph 2.1.4
• image.binarization 0.1.3
• imager 1.0.3
• imagerExtra 1.3.2
• ineq-0.2-13
• influenceR 0.1.5
• infotheo 1.2.0.1
• inline 0.3.21
• insight 1.3.0
• intergraph-2.0-4
• interp-1.1-6
• interpretR 0.2.5
• intrinsicDimension 1.2.0
• inum-1.0-5
• ipred-0.9-15
• irace 4.2.0
• irlba 2.3.5.1
• ismev 1.42
• Iso-0.0-21
• isoband 0.2.7
• ISOcodes 2025.05.18
• ISOweek-0.6-2
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• itertools-0.1-3
• JADE-2.0-4
• janeaustenr 1.0.0
• JBTools 0.7.2.9
• jiebaR 0.11.1
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• jose 1.2.1
• jpeg-0.1-11
• jsonify 1.2.2
• jstable 1.3.12
• juicyjuice 0.1.0
• kableExtra 1.4.0
• kde1d 1.1.0
• kedd 1.0.4
• kernlab-0.9-33
• KernSmooth-2.23-26
• kinship2 1.9.6.1
• klaR-1.7-3
• KODAMA 3.0
• kohonen 3.0.12
• ks 1.15.1
• labdsv-2.1-0
• labeling 0.4.3
• labelled 2.14.1
• laeken 0.5.3
• lambda.r 1.2.4
• LaplacesDemon 16.1.6
• lars 1.3
• lassosum 0.4.5
• lattice-0.22-7
• latticeExtra-0.6-30
• lava 1.8.1
• lavaan-0.6-19
• lazy-1.2-18
• lazyeval 0.2.2
• LCFdata 2.0
• lda 1.5.2
• ldbounds 2.0.2
• leafem 0.2.4
• leafgl 0.2.2
• leaflegend 1.2.1
• leaflet 2.2.2
• leaflet.providers 2.0.0
• leafsync 0.1.0
• leaps 3.2
• LearnBayes 2.15.1
• leiden 0.4.3.1
• lhs 1.2.0
• libcoin-1.0-10
• limSolve 1.5.7.2
• linkcomm-1.0-14
• linprog-0.9-4
• liquidSVM 1.2.4
• listenv 0.9.1
• litedown 0.7
• lme4-1.1-37
• LMERConvenienceFunctions 3.0
• lmerTest-3.1-3
• lmom 3.2
• Lmoments-1.3-1
• lmtest-0.9-40
• lobstr 1.1.2
• locfdr-1.1-8
• locfit-1.5-9.12
• logcondens 2.1.8
• logger 0.4.0
• logging-0.10-108
• logistf 1.26.1
• logspline 2.1.22
• longitudinal 1.1.13
• longmemo-1.1-3
• loo 2.8.0
• lpSolve 5.6.23
• lpSolveAPI-5.5.2.0-17.14
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• lsei-1.3-0
• lslx 0.6.11
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• lwgeom-0.2-14
• magic-1.6-1
• magick 2.8.6
• MALDIquant 1.22.3
• manipulateWidget 0.11.1
• mapproj 1.2.12
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• maptiles 0.10.0
• markdown 2.0
• MASS-7.3-65
• Matching-4.10-15
• MatchIt 4.7.2
• mathjaxr-1.8-0
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• matrixcalc-1.0-6
• MatrixModels-0.5-4
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• mclogit 0.9.6
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• ModelMetrics 1.2.2.2
• modelr 0.1.11
• modeltools-0.2-24
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• multcompView-0.1-10
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• multipol-1.0-9
• multitaper-1.0-17
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Last modified on 7th June 2025