R-bundle-CRAN 2024.06-foss-2023a

Bundle of R packages from CRAN

Accessing R-bundle-CRAN 2024.06-foss-2023a

To load the module for R-bundle-CRAN 2024.06-foss-2023a please use this command on the BEAR systems (BlueBEAR and BEAR Cloud VMs):

📋 module load bear-apps/2023a
module load R-bundle-CRAN/2024.06-foss-2023a

BEAR Apps Version

2023a

Architectures

EL8-cascadelake — EL8-icelake — EL8-sapphirerapids

The listed architectures consist of two part: OS-CPU. The OS used is represented by EL and there are several different processor (CPU) types available on BlueBEAR. More information about the processor types on BlueBEAR is available on the BlueBEAR Job Submission page.

Extensions

• abc 2.2.1
• abc.data 1.1
• abe 3.0.1
• abind-1.4-5
• acepack 1.4.2
• adabag 5.0
• ade4-1.7-22
• ADGofTest 0.3
• admisc 0.35
• aggregation 1.0.1
• AICcmodavg-2.3-3
• akima-0.6-3.4
• alabama 2023.1.0
• AlgDesign 1.2.1
• alluvial-0.1-2
• AMAPVox 2.2.1
• animation 2.7
• aod 1.3.3
• apcluster 1.4.13
• ape 5.8
• aplot 0.2.3
• argparse 2.2.3
• aricode 1.0.3
• arm-1.14-4
• arrayhelpers-1.1-0
• asnipe 1.1.17
• assertive-0.3-6
• assertive.base-0.0-9
• assertive.code-0.0-4
• assertive.data-0.0-3
• assertive.data.uk-0.0-2
• assertive.data.us-0.0-2
• assertive.datetimes-0.0-3
• assertive.files-0.0-2
• assertive.matrices-0.0-2
• assertive.models-0.0-2
• assertive.numbers-0.0-2
• assertive.properties-0.0-5
• assertive.reflection-0.0-5
• assertive.sets-0.0-3
• assertive.strings-0.0-3
• assertive.types-0.0-3
• assertthat 0.2.1
• AUC 0.3.2
• audio-0.1-11
• aws-2.5-5
• awsMethods-1.1-1
• backports 1.5.0
• bacr 1.0.1
• bartMachine 1.3.4.1
• bartMachineJARs 1.2.1
• base64 2.0.1
• BatchJobs 1.9
• batchmeans-1.0-4
• BayesianTools 0.1.8
• BayesLogit 2.1
• bayesm-3.1-6
• BayesPen 1.0
• bayesplot 1.11.1
• BB-2019.10-1
• BBmisc 1.13
• bbmle 1.0.25.1
• BCEE 1.3.2
• BDgraph 2.72
• bdsmatrix-1.3-7
• beanplot 1.3.1
• beeswarm 0.4.0
• berryFunctions 1.22.5
• betareg-3.1-4
• BH-1.84.0-0
• BiasedUrn 2.0.12
• bibtex 0.5.1
• BIEN 1.2.6
• bigD 0.2.0
• BIGL 1.9.1
• bigmemory 4.6.4
• bigmemory.sri 0.1.8
• bindr 0.1.1
• bindrcpp 0.2.3
• bio3d-2.4-4
• biom 0.3.12
• biomod2-4.2-5-2
• bit 4.0.5
• bit64 4.0.5
• bitops-1.0-7
• blavaan-0.5-5
• blob 1.2.4
• BMA 3.18.17
• bmp 0.3
• bnlearn 4.9.4
• bold 1.3.0
• boot-1.3-30
• bootstrap 2019.6
• Boruta 8.0.0
• brglm 0.7.2
• bridgedist 0.1.2
• bridgesampling-1.1-2
• brms 2.21.0
• Brobdingnag-1.2-9
• broom 1.0.6
• broom.helpers 1.15.0
• broom.mixed 0.2.9.5
• bst-0.3-24
• Cairo-1.6-2
• calibrate 1.7.7
• car-3.1-2
• carData-3.0-5
• caret-6.0-94
• catlearn 1.0
• caTools 1.18.2
• CBPS 0.23
• celestial 1.4.6
• cellranger 1.1.0
• cgdsr 1.3.0
• cghFLasso-0.2-1
• changepoint 2.2.4
• checkmate 2.3.1
• chemometrics 1.4.4
• chk 0.9.1
• chkptstanr 0.1.1
• chron-2.3-61
• circlize 0.4.16
• circular-0.5-0
• class-7.3-22
• classInt-0.4-10
• cld2 1.2.4
• clisymbols 1.2.0
• clock 0.7.0
• clue-0.3-65
• cluster 2.1.6
• clusterGeneration 1.3.8
• clusterRepro 0.9
• clustree 0.5.1
• clValid 0.7
• cmna 1.0.5
• cmprsk-2.2-12
• cNORM 3.0.4
• cobalt 4.5.5
• cobs-1.3-8
• coda-0.19-4.1
• codetools-0.2-20
• coin-1.4-3
• collapse 2.0.14
• colorspace-2.1-0
• colourpicker 1.3.0
• combinat-0.0-8
• ComICS 1.0.4
• ComplexUpset 1.3.3
• compositions-2.0-8
• CompQuadForm 1.4.3
• conditionz 0.1.0
• conflicted 1.2.0
• conquer 1.3.3
• ConsRank 2.1.4
• contfrac-1.1-12
• copCAR-2.0-4
• copula-1.1-3
• corpcor 1.6.10
• corrplot 0.92
• covr 3.6.4
• CovSel 1.2.1
• covsim 1.1.0
• cowplot 1.1.3
• coxed 0.3.3
• coxme-2.2-20
• crfsuite 0.4.2
• crosstalk 1.2.1
• crul 1.4.2
• cSEM 0.5.0
• csSAM 1.2.4
• ctmle 0.1.2
• cubature 2.1.0
• cubelyr 1.0.2
• cvAUC 1.1.4
• CVST-0.2-3
• CVXR-1.0-13
• d3Network 0.5.2.1
• dagitty-0.3-4
• data.table 1.15.4
• data.tree 1.1.0
• DataCombine 0.2.21
• date-1.2-42
• dbarts-0.9-28
• DBI 1.2.3
• dbplyr 2.5.0
• dbscan-1.1-12
• dcurver 0.9.2
• ddalpha 1.3.15
• deal-1.2-42
• debugme 1.2.0
• deldir-2.0-4
• dendextend 1.17.1
• DEoptim-2.2-8
• DEoptimR-1.1-3
• DepthProc 2.1.5
• Deriv 4.1.3
• DescTools 0.99.54
• deSolve 1.40
• dfidx-0.0-5
• DHARMa 0.4.6
• dHSIC 2.1
• diagram 1.6.5
• DiagrammeR 1.0.11
• DiceKriging 1.6.0
• dichromat-2.0-0.1
• dimRed 0.2.6
• diptest-0.77-1
• DiscriMiner-0.1-29
• dismo-1.3-14
• distillery-1.2-1
• distr 2.9.3
• distrEx 2.9.2
• distributional 0.4.0
• DistributionUtils-0.6-1
• diveRsity 1.9.90
• dlm-1.1-6
• DMCfun 3.5.4
• doc2vec 0.2.0
• docstring 1.0.0
• doMC 1.3.8
• doParallel 1.0.17
• doRNG 1.8.6
• doSNOW 1.0.20
• dotCall64-1.1-1
• downloader 0.4
• dplyr 1.1.4
• dr 3.0.10
• dreamerr 1.4.0
• drgee 1.1.10
• DRR 0.0.4
• drugCombo 1.2.1
• DT 0.33
• dtangle 2.0.9
• dtplyr 1.3.1
• DTRreg 2.2
• dtw-1.23-1
• dummies 1.5.6
• dygraphs 1.1.1.6
• dynamicTreeCut-1.63-1
• e1071-1.7-14
• earth 5.3.3
• EasyABC 1.5.2
• ECOSolveR 0.5.5
• ellipse 0.5.0
• elliptic-1.4-0
• emdbook 1.3.13
• emmeans 1.10.2
• emoa-0.5-2
• emulator-1.2-24
• energy-1.7-11
• ENMeval 2.0.4
• entropy 1.3.1
• EnvStats 2.8.1
• epitools-0.5-10.1
• ergm 4.6.0
• ergm.count 4.1.2
• ergm.multi 0.2.1
• estimability 1.5.1
• EValue 4.1.3
• evd-2.3-7
• Exact 3.2
• expm-0.999-9
• ExPosition 2.8.23
• expsmooth 2.3
• extrafont 0.19
• extrafontdb 1.0
• extRemes-2.1-4
• FactoMineR 2.11
• FactorCopula 0.9.3
• fail 1.3
• farver 2.1.2
• fastcluster 1.2.6
• fastDummies 1.7.3
• fasterize 1.0.5
• fastICA-1.2-4
• fastmatch-1.1-4
• fdrtool 1.2.17
• feather 0.3.5
• ff 4.0.12
• fftw-1.0-8
• fftwtools-0.9-11
• fields 15.2
• filehash-2.4-5
• finalfit 1.0.7
• findpython 1.0.8
• fishMod 0.29
• fitdistrplus-1.1-11
• fixest 0.12.1
• FKSUM 1.0.1
• flashClust-1.01-2
• flexclust-1.4-2
• flexmix-2.3-19
• flextable 0.9.6
• fma 2.5
• FME 1.3.6.3
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• fontBitstreamVera 0.1.1
• fontLiberation 0.1.0
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• forcats 1.0.0
• foreach 1.5.2
• forecast 8.23.0
• foreign-0.8-86
• formatR 1.14
• Formula-1.2-5
• formula.tools 1.7.1
• fossil 0.4.0
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• fracdiff-1.5-3
• furrr 0.3.1
• futile.logger 1.4.3
• futile.options 1.0.1
• future 1.33.2
• future.apply 1.11.2
• gam-1.22-3
• gamlss-5.4-22
• gamlss.data-6.0-6
• gamlss.dist-6.1-1
• gamlss.tr-5.1-9
• gamm4-0.2-6
• gap-1.5-3
• gap.datasets 0.0.6
• gapfill-0.9.6-1
• gargle 1.5.2
• gaussquad-1.0-3
• gbm 2.1.9
• gbRd 0.4.12
• gclus 1.3.2
• gdalUtils 2.0.3.2
• gdata 3.0.0
• gdistance 1.6.4
• gdtools 0.3.7
• gee-4.13-27
• geeM 0.10.1
• geepack 1.3.11
• geex 1.1.1
• geiger 2.0.11
• GeneNet 1.2.16
• generics 0.1.3
• genoPlotR 0.8.11
• GenSA 1.1.14
• geojsonsf 2.0.3
• geometries 0.2.4
• geometry 0.4.7
• getopt 1.20.4
• GetoptLong 1.0.5
• gfonts 0.2.0
• GGally 2.2.1
• ggbeeswarm 0.7.2
• ggdag 0.2.12
• ggdist 3.3.2
• ggExtra 0.10.1
• ggfan 0.1.3
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• ggformula 0.12.0
• ggfun 0.1.5
• ggh4x 0.2.8
• ggnetwork 0.5.13
• ggplot2 3.5.1
• ggplotify 0.1.2
• ggpubr 0.6.0
• ggraph 2.2.1
• ggrepel 0.9.5
• ggridges 0.5.6
• ggsci 3.2.0
• ggsignif 0.6.4
• ggstance 0.3.7
• ggstats 0.6.0
• ggvenn 0.1.10
• ggvis 0.4.9
• GillespieSSA 0.6.2
• git2r 0.33.0
• GJRM-0.2-6.5
• glasso 1.11
• gld 2.6.6
• gllvm 1.4.3
• glmmML 1.1.6
• glmmTMB 1.1.9
• glmnet-4.1-8
• GlobalOptions 0.1.2
• globals 0.16.3
• gmm 1.8
• gmodels 2.19.1
• gmp-0.7-4
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• gower 1.0.1
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• gplots 3.1.3.1
• graphlayouts 1.1.1
• grf 2.3.2
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• gridGraphics-0.5-1
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• gtable 0.3.5
• gtools 3.9.5
• gtsummary 1.7.2
• GUTS 1.2.5
• gWidgets2-1.0-9
• gWidgets2tcltk-1.0-8
• GxEScanR 2.0.2
• h2o 3.44.0.3
• hal9001 0.4.6
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• hardhat 1.4.0
• harmony 1.2.0
• hash 2.2.6.3
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• HiddenMarkov-1.8-13
• Hmisc-5.1-3
• hms 1.1.3
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• httpcode 0.3.0
• huge 1.3.5
• hunspell 3.0.3
• hwriter 1.3.2.1
• HWxtest 1.1.9
• hypergeo-1.2-13
• ica-1.0-3
• IDPmisc 1.1.21
• idr 1.3
• ids 1.0.1
• ie2misc 0.9.1
• igraph 2.0.3
• image.binarization 0.1.3
• imager 1.0.2
• imagerExtra 1.3.2
• ineq-0.2-13
• influenceR 0.1.5
• infotheo 1.2.0.1
• inline 0.3.19
• intergraph-2.0-4
• interp-1.1-6
• interpretR 0.2.5
• intrinsicDimension 1.2.0
• inum-1.0-5
• ipred-0.9-14
• irace 3.5
• irlba 2.3.5.1
• ismev 1.42
• Iso-0.0-21
• isoband 0.2.7
• ISOcodes 2024.02.12
• ISOweek-0.6-2
• iterators 1.0.14
• itertools-0.1-3
• JADE-2.0-4
• janeaustenr 1.0.0
• JBTools 0.7.2.9
• jiebaR 0.11
• jiebaRD 0.1
• jomo-2.7-6
• jpeg-0.1-10
• jsonify 1.2.2
• jstable 1.2.6
• juicyjuice 0.1.0
• kde1d 1.0.7
• kedd 1.0.4
• kernlab-0.9-32
• KernSmooth-2.23-24
• kinship2 1.9.6.1
• klaR-1.7-3
• KODAMA 2.4
• kohonen 3.0.12
• ks 1.14.2
• labdsv-2.1-0
• labeling 0.4.3
• labelled 2.13.0
• laeken 0.5.3
• lambda.r 1.2.4
• LaplacesDemon 16.1.6
• lars 1.3
• lassosum 0.4.5
• lattice-0.22-6
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• lda 1.5.2
• ldbounds 2.0.2
• leafem 0.2.3
• leaflet 2.2.2
• leaflet.providers 2.0.0
• leafsync 0.1.0
• leaps 3.2
• LearnBayes 2.15.1
• leiden 0.4.3.1
• lhs 1.1.6
• libcoin-1.0-10
• limSolve 1.5.7.1
• linkcomm-1.0-14
• linprog-0.9-4
• liquidSVM 1.2.4
• listenv 0.9.1
• lme4-1.1-35.4
• LMERConvenienceFunctions 3.0
• lmerTest-3.1-3
• lmom 3.0
• Lmoments-1.3-1
• lmtest-0.9-40
• lobstr 1.1.2
• locfdr-1.1-8
• locfit-1.5-9.10
• logcondens 2.1.8
• logger 0.3.0
• logistf 1.26.0
• logspline 2.1.22
• longitudinal 1.1.13
• longmemo-1.1-2
• loo 2.7.0
• lpSolve 5.6.20
• lpSolveAPI-5.5.2.0-17.11
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• lsei-1.3-0
• lslx 0.6.11
• lubridate 1.9.3
• lwgeom-0.2-14
• magic-1.6-1
• magick 2.8.3
• MALDIquant 1.22.2
• manipulateWidget 0.11.1
• mapproj 1.2.11
• maps 3.4.2
• maptools-1.1-8
• markdown 1.13
• MASS-7.3-61
• Matching-4.10-14
• MatchIt 4.5.5
• mathjaxr-1.6-0
• matlab 1.0.4
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• matrixcalc-1.0-6
• MatrixModels-0.5-3
• matrixStats 1.3.0
• maxLik-1.5-2.1
• maxlike-0.1-11
• maxnet 0.1.4
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• metafor-4.6-0
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• miceadds-3.17-44
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Last modified on 28th June 2024